VeriFactu en la farmacia: qué es, cómo puede afectar al sector y cómo prepararse para el cambio

El calendario de implantación de los nuevos requisitos de facturación ha experimentado diferentes modificaciones. En octubre de 2026, el Ministerio de Hacienda anunció la previsión de ampliar hasta octubre de 2028 el plazo de adaptación de los sistemas informáticos de facturación, con el objetivo de coordinar su implantación con la factura electrónica obligatoria. Mientras se concreta este nuevo calendario, las farmacias pueden aprovechar este periodo para revisar sus sistemas de facturación y prepararse para los requisitos establecidos por el Real Decreto 1007/2023.

¿Qué es VeriFactu?

VeriFactu es un sistema promovido por la Agencia Tributaria dentro de la Ley Antifraude (Ley 11/2021) cuyo objetivo es garantizar la autenticidad, integridad, trazabilidad e inalterabilidad de las facturas emitidas desde programas de facturación.

En la práctica, el sistema obliga a que cada factura generada desde un software de gestión incluya elementos de seguridad y verificación, como: un código QR, una huella digital o “hash”, un identificador único y registros seguros que no puedan modificarse posteriormente.

El objetivo es reducir el fraude fiscal y mejorar la trazabilidad de las operaciones económicas.

¿VeriFactu será obligatorio para las farmacias?

Aquí es donde aparece una de las principales confusiones.

Lo que será obligatorio es utilizar un sistema informático de facturación (SIF) adaptado a los requisitos del Real Decreto 1007/2023. Sin embargo, actualmente existen dos modalidades posibles:

• Sistemas con VeriFactu, que envían la información automáticamente a la AEAT
• Sistemas sin VeriFactu, que cumplen igualmente la normativa, pero sin remisión automática en tiempo real

El calendario de implantación ha experimentado sucesivos aplazamientos. En octubre de 2026, el Ministerio de Hacienda anunció la previsión de ampliar hasta octubre de 2028 el plazo de adaptación de los sistemas informáticos de facturación, con el objetivo de coordinar su implantación con la factura electrónica obligatoria.

Este nuevo plazo ha sido anunciado oficialmente, aunque está pendiente de su correspondiente modificación normativa. Hasta que esta se produzca, la normativa vigente mantiene como fechas de referencia el 1 de enero de 2027 para los contribuyentes del Impuesto sobre Sociedades y el 1 de julio de 2027 para el resto de obligados tributarios.

Por ello, es recomendable consultar las actualizaciones de la Agencia Tributaria y aprovechar este periodo para revisar con el proveedor tecnológico la adaptación del sistema de facturación de la farmacia.

¿Cómo puede afectar VeriFactu a la farmacia comunitaria?

El impacto no se limita únicamente a la parte fiscal. VeriFactu puede influir directamente en distintos aspectos de la gestión diaria de la farmacia:

Adaptación del software de gestión

La principal implicación de VeriFactu para la farmacia será tecnológica. Las farmacias deberán asegurarse de que su software de gestión esté preparado para cumplir los nuevos requisitos de la normativa, como la generación de códigos QR, los registros inalterables, la trazabilidad de las operaciones, el almacenamiento seguro de la información y, en algunos casos, la comunicación automática con la Agencia Tributaria (AEAT). Por ello, será fundamental contactar con el proveedor del programa de gestión para confirmar si el sistema ya está adaptado, si permitirá elegir entre modalidad VeriFactu o no VeriFactu y qué actualizaciones o cambios serán necesarios para cumplir correctamente con la normativa.

Cambios en los procesos internos

La nueva normativa también obligará a revisar determinados procesos de facturación y organización contable dentro de la farmacia. Aspectos como la emisión de facturas, la conservación de registros, el control documental o la coherencia de la información fiscal cobrarán todavía más importancia. Aunque gran parte del proceso estará automatizado, el orden interno y el uso correcto del sistema seguirán siendo fundamentales para garantizar el cumplimiento normativo y evitar incidencias.

Mayor trazabilidad y control

Cada factura tendrá un identificador único y quedará registrada de forma verificable, lo que puede aportar una mayor seguridad jurídica, reducir errores, facilitar auditorías y mejorar el control interno de la farmacia. Al mismo tiempo, muchas farmacias muestran dudas relacionadas con la privacidad fiscal y el nivel de supervisión administrativa, especialmente en aquellos casos en los que se opte por la modalidad con envío automático de información a la AEAT.

Una de las grandes dudas: ¿Hacienda verá todas las facturas en tiempo real?

No necesariamente.

Uno de los mensajes más repetidos en los últimos meses es que “todas las farmacias tendrán que enviar automáticamente sus facturas a Hacienda”. Sin embargo, esto no es exactamente así.

Actualmente, existen dos opciones legales:

Modalidad VeriFactu

• envío automático de registros a la AEAT,
• mayor automatización,
• más trazabilidad inmediata,
• menor gestión manual.

Modalidad NO VeriFactu

• no hay envío automático,
• las facturas se conservan en el sistema interno,
• pero el software debe cumplir igualmente todos los requisitos técnicos y de seguridad.

Es decir, no utilizar VeriFactu no significa incumplir la normativa.

Entonces, ¿qué modalidad puede interesar más a una farmacia?

No existe una única respuesta válida. Dependerá del tipo de farmacia, su volumen de facturación y su nivel de digitalización.

La modalidad con VeriFactu puede resultar interesante para:

• farmacias con alto volumen de facturación,
• relación frecuente con administración pública,
• aseguradoras,
• o necesidad de máxima automatización.

Por otro lado, algunas farmacias pueden preferir mantener un mayor control interno mediante sistemas sin envío automático.

En cualquier caso, ambas modalidades exigen utilizar un software adaptado y cumplir las obligaciones técnicas establecidas por la normativa.

¿Qué preguntas deberían hacerse ahora las farmacias?

El aplazamiento anunciado ofrece a las farmacias un mayor margen para revisar algunos aspectos clave:

• ¿Mi software actual está adaptado al RD 1007/2023?
• ¿Mi proveedor permitirá elegir modalidad?
• ¿Cómo afectará esto a la dinámica de facturación diaria?
• ¿El equipo conoce los cambios básicos que pueden producirse?
• ¿La farmacia dispone de protocolos claros de gestión documental?
• ¿Será necesario actualizar equipos o procesos internos?

Aprovechar este periodo para revisar los sistemas y procesos de facturación puede facilitar una adaptación progresiva una vez quede definido el nuevo calendario normativo.

Formación y acompañamiento: claves para adaptarse sin complicaciones

Uno de los aspectos más repetidos por asesorías y entidades del sector es la importancia de la formación. Aunque gran parte de la adaptación será tecnológica, el equipo de farmacia necesitará entender:

• cómo funciona el sistema,
• qué cambia respecto al modelo actual,
• cómo verificar facturas,
• y cómo actuar ante incidencias o dudas.

Además, muchas empresas tecnológicas ya están desarrollando contenidos específicos para acompañar a las farmacias durante esta transición.

La formación no debería entenderse únicamente como una obligación técnica, sino como una herramienta para reducir incertidumbre y facilitar la adaptación progresiva.

Más allá de la obligación: una oportunidad para modernizar procesos

Aunque VeriFactu suele percibirse inicialmente como una nueva carga administrativa, diferentes expertos del sector coinciden en que también puede convertirse en una oportunidad para revisar y mejorar la organización interna de la farmacia.

La automatización de procesos, la mejora de la trazabilidad, la reducción de errores y una gestión documental más estructurada pueden contribuir a una farmacia más eficiente y preparada para futuros cambios regulatorios.

En definitiva, el nuevo aplazamiento previsto amplía el margen de adaptación para las farmacias, pero no modifica el objetivo de la normativa: garantizar que los sistemas informáticos de facturación cumplan los requisitos de integridad, conservación, accesibilidad, legibilidad, trazabilidad e inalterabilidad de los registros. Mantenerse al día de las novedades normativas y revisar con antelación los sistemas y procesos de facturación permitirá afrontar la transición de forma progresiva.

NPS-ES-NP-01112 (Octubre 2026)

Referencias:

Verifactu: ¿qué es y cómo afectará a la facturación de tu farmacia? NIXFARMA. [Acceso 06/05/2026] Disponible en: https://www.nixfarma.es/verifactu-que-es-y-como-afectara-a-la-facturacion-de-tu-farmacia/

Este es el impacto de Verifactu en la facturación farmacéutica. El Globofarma. [Acceso 06/05/2026] Disponible en: https://elglobalfarma.com/farmacia/verifactu-facturacion-farmaceutica/

Verifactu en farmacias: obligatoriedad, fechas y requisitos. Gómez Córdoba. [Acceso 06/05/2026] Disponible en: https://gomezcordoba.com/verifactu-en-farmacias/

Verifactu en farmacias: cómo prepararse para el nuevo sistema de facturación. Diario Farma. [Acceso 06/05/2026] Disponible en: Verifactu en farmacias: cómo prepararse para el nuevo sistema de facturación | @diariofarma

¿Qué es VeriFactu y por qué es importante? Farma School. [Acceso 06/05/2026] Disponible en: ¿Qué es VeriFactu y por qué es importante? - Farmaschool

Agencia Estatal de Administración Tributaria (AEAT). Sistemas Informáticos de Facturación (SIF) y VERI*FACTU. [Acceso 22/10/2026] Disponible en: Comunicación del Ministerio de Hacienda de 05/10/2026: Previsión de ampliación del plazo de adaptación de los sistemas informáticos de facturación (SIF)